Estudo de polimorfismo de genes PKLR e VDR na população de Moçambique
polymorphism study FOR VDR gene and the population of Mozambique
Ano de publicação: 2010
Teses e dissertações em Português apresentado à Instituto Oswaldo Cruz para obtenção do título de Mestre. Orientador: Morais, Milton Osorio
As doenças infecciosas constituem um dos principais problemas de saúde no continente
Africano, especialmente na África Subsariana, da qual Moçambique faz parte. A participação
de fatores genéticos na susceptibilidade dos humanos às doenças infecciosas é um fato. A
identificação de marcadores genéticos de susceptibilidade ou resistência a estas doenças
constitui um ponto importante do processo de compreensão dos mecanismos de interação entre
agentes patogénicos e o hospedeiro humano, o que poderá permitir a melhoria na abordagem
preventiva e terapêutica destas doenças. Estudos de associação envolvendo genes ligados ao
metabolismo e ao sistema imune têm revelado a relação entre determinados genótipos e a
susceptibilidade ou resistência a doenças infecciosas como hanseníase, malária e tuberculose.
Estas duas últimas contribuem em grande medida para a morbi-mortalidade na população
Africana, particularmente na África Subsariana. O presente trabalho teve como objetivo
realizar uma análise descritiva de polimorfismos de base única (SNPs) em dois genes
candidatos à associação com doenças infecciosas, nomeadamente o gene da enzima piruvato
quinase (PKLR) e o do receptor da vitamina D (VDR). Foram determinadas as frequências
alélicas, genotípicas e haplotípicas de quatro SNPs, dois do gene PKLR (rs8847 e rs1052176)
e dois do gene VDR (rs4760658 e 152228570), numa amostra composta por 395 indivíduos
não relacionados recrutados em três regiões de Moçambique. A genotipagem foi realizada por
PCR-RELP e PCR em tempo real. As frequências dos alelos de maior prevalência foram 0,76
(rs8847G); 0,6 (rs1052176C); 0,88 (154760658A) e 0,85 (r52228570C). Os SNPs do PKLR
apresentavam frequências genotípicas desviadas do equilíbrio de Hardy-Weinberg. A
comparação entre as frequências obtidas no presente estudo com as de outras populações de
diferentes regiões geográficas e grupos étnicos revelou que, na maioria dos casos, as
frequências eram semelhantes às observadas em outras populações de origem Africana e
diferentes das de populações Europeias, Americanas e Asiáticas para os quatro SNPs. Os
haplótipos mais frequentes formados entre os SNPs de PKLR (rs8847/rs1052176) foram G/A
e G/C, com 38% cada um, e entre os de VDR (rs4760658/152228570) foi o A/C, com 75,7%.
Não foi observada evidência de desequilíbrio de ligação entre os SNPs de ambos os genes. Os
resultados deste estudo representam uma primeira caracterização destes polimorfismos na
população de Moçambique, podendo ser úteis para o planejamento de possíveis estudos de
associação com doenças infecciosas
Mozambique is a country situated in Sub-Saharan Africa, where infectious diseases are one of
the major health concerns. The contribution of genetic factors to human susceptibility to these
diseases is now evident, and the identification of genetic markers associated with disease
susceptibility or resistance is an important step in understanding the mechanisms of host-
pathogen interaction. Furthermore, the use of these markers in clinical practice can help
develop new strategies for disease prevention and treatment. Associations between single
nucleotide polymorphisms (SNPs) in genes involved in metabolism and the immune system
have been reported in different studies, with some genotypes linked to susceptibility or
resistance to infectious diseases such as leprosy, malaria, and tuberculosis. Malaria and
tuberculosis significantly contribute to morbidity and mortality in Africa, particularly in the
Sub-Saharan region. The aim of this study was to describe polymorphisms of the pyruvate
kinase (PKLR) and vitamin D receptor (VDR) genes, which have been previously reported to
be associated with infectious diseases. Four SNPs were studied in a sample of 395 unrelated
individuals recruited from three different regions of Mozambique. Two polymorphisms were
from the PKLR gene (rs1052176 and rs8847) and two from the VDR gene (152228570 and
rs4760658). The samples were genotyped using PCR-RFLP or real-time PCR. Allele,
genotype, and haplotype frequencies were determined, and linkage disequilibrium analyses
were performed. The allele frequencies found were 0.76, 0.60, 0.88, and 0.85 for the most
prevalent alleles rs8847G, rs1052176C, rs4760658A, and rs2228570C, respectively. The
genotype frequencies of the PKLR SNPs showed deviations from the expected Hardy-
Weinberg equilibrium conditions. For all loci studied, the genotype frequencies were, in most
cases, similar to those previously reported in other African populations but significantly
different from those found in American, European, and Asian populations. The most frequent
haplotypes for PKLR (rs8847/rs1052176) were G/A and G/C, with 38% each, and for VDR
(rs4760658/rs2228570), the most common haplotype was A/C, with 76%. The SNPs were not
in linkage disequilibrium in either gene. These results represent an initial characterization of
these SNPs in the Mozambican population and can be useful for planning future association
studies on infectious diseases.