BACKGROUND: This study aimed to investigate the gene expression changes associated with carcinoma-associated fibroblasts (CAFs) involving in non-small cell lung carcinoma (NSCLC). METHODS: We downloaded the GEO series GSE22862, which contained matched gene expression values for 15 CAF and normal fibrobla...
Fibroblastos Asociados al Cáncer,
Carcinoma/genética,
Carcinoma de Pulmón de Células no Pequeñas/genética,
Regulación Neoplásica de la Expresión Génica,
Neoplasias Pulmonares/genética,
Carcinoma/patología,
Carcinoma de Pulmón de Células no Pequeñas/patología,
Neoplasias Pulmonares/patología,
Factor de Crecimiento Transformador beta/genética,
Alelos,
Regulación hacia Abajo,
Dosificación de Gen,
Perfilación de la Expresión Génica,
Ontología de Genes,
Estudios de Asociación Genética,
Pérdida de Heterocigocidad,
Mapas de Interacción de Proteínas,
Análisis de Matrices Tisulares,
Regulación hacia Arriba
BACKGROUND: Cocaine- and amphetamine-regulated transcript (CART), discovered initially by via differential display RT-PCR analysis of brains of rats administered cocaine, is expressed mainly in central nervous system or neuronal origin cells, and is involved in a wide range of behaviors, such as regulati...
BACKGROUND: Earthworms are sensitive to toxic chemicals present in the soil and so are useful indicator organisms for soil health. Eisenia fetida are commonly used in ecotoxicological studies; therefore the assembly of a baseline transcriptome is important for subsequent analyses exploring the impact of ...
Ecotoxicología,
Perfilación de la Expresión Génica/métodos,
Oligoquetos/genética,
Transcriptoma,
Oligoquetos/efectos de los fármacos,
Análisis de Secuencia de ARN/métodos,
Contaminantes del Suelo/toxicidad,
Toxicogenética/métodos,
Exposición a Riesgos Ambientales,
Ontología de Genes,
Programas Informáticos
Platycladus orientalis has a lifespan of several thousand years in China, making it a good plant in which to study aging at the molecular level, but this requires sufficient quantities of high-quality P. orientalis RNA. However, no appropriate methods have been reported for total RNA isolation from P. or...
INTRODUÇÃO: O tratamento do carcinoma gástrico (CG) é complexo e requer recursos intensivos. Atualmente, a cirurgia é a única opção curativa disponível para o tratamento de pacientes com CG. Na última década observou-se um grande avanço no tratamento multimodal destes pacientes devido ao reco...
Dilated cardiomyopathy (DCM) is characterized by ventricular dilatation, and it is a common cause of heart failure and cardiac transplantation. This study aimed to explore potential DCM-related genes and their underlying regulatory mechanism using methods of bioinformatics. The gene expression profiles o...
Cardiomiopatía Dilatada/genética,
Biología Computacional/métodos,
Regulación hacia Abajo,
Perfilación de la Expresión Génica/métodos,
MicroARNs,
Receptores Androgénicos/genética,
Valores de Referencia,
Transducción de Señal/genética,
Factores de Transcripción/genética,
Transcriptoma,
Regulación hacia Arriba
Ropinirole (ROP) is a dopamine agonist that has been used as therapy for Parkinson's disease. In the present study, we aimed to detect whether gene expression was modulated by ROP in SH-SY5Y cells. SH-SY5Y cell lines were treated with 10 µM ROP for 2 h, after which total RNA was extracted for whole geno...
Antiparkinsonianos/farmacología,
Western Blotting,
Línea Celular Tumoral,
Cromosomas Humanos Par 1,
Fosfatidilinositol 3-Quinasas Clase II/genética,
Fosfatidilinositol 3-Quinasas Clase II/metabolismo,
Agonistas de Dopamina/farmacología,
Expresión Génica/efectos de los fármacos,
Perfilación de la Expresión Génica/métodos,
Indoles/farmacología,
Análisis por Micromatrices/métodos,
Neuroblastoma,
Análisis de Secuencia por Matrices de Oligonucleótidos/métodos,
Regulación hacia Arriba
BACKGROUND: Wnt-5a is a member of the WNT family of secreted lipoglycoproteins, whose expression increases during development; moreover, Wnt-5a plays a key role in synaptic structure and function in the adult nervous system. However, the mechanism underlying these effects is still elusive. MicroRNAs (miR...
Ciclooxigenasa 2/análisis,
Hipocampo/enzimología,
MicroARNs/fisiología,
Neuronas/enzimología,
Proteínas Wnt/fisiología,
Hipocampo/química,
Neuronas/química,
Western Blotting,
Células Cultivadas,
Regulación hacia Abajo,
Expresión Génica,
Perfilación de la Expresión Génica,
Marcación de Gen,
Plasticidad Neuronal,
Ratas Sprague-Dawley,
Reacción en Cadena en Tiempo Real de la Polimerasa,
Proteína Wnt-5a
BACKGROUND: Acute respiratory distress syndrome (ARDS) is a potentially devastating form of acute inflammatory lung injury as well as a major cause of acute respiratory failure. Although researchers have made significant progresses in elucidating the pathophysiology of this complex syndrome over the year...
Trastornos Respiratorios/genética,
Sepsis/complicaciones,
Sepsis/genética,
Estudios de Asociación Genética,
Transcriptoma,
Ciclo Celular/genética,
Bases de Datos Genéticas,
Regulación hacia Abajo,
Perfilación de la Expresión Génica,
Marcación de Gen,
Mapas de Interacción de Proteínas,
Factores de Transcripción,
Regulación hacia Arriba
BACKGROUND: Cellular senescence is induced either internally, for example by replication exhaustion and cell division, or externally, for example by irradiation. In both cases, cellular damages accumulate which, if not successfully repaired, can result in senescence induction. Recently, we determined the...
Senescencia Celular/fisiología,
Fibroblastos/efectos de la radiación,
Senescencia Celular/genética,
Senescencia Celular/efectos de la radiación,
Reparación del ADN/efectos de la radiación,
Replicación del ADN/efectos de la radiación,
Regulación hacia Abajo/efectos de la radiación,
Fibroblastos/fisiología,
Regulación hacia Arriba/efectos de la radiación,
beta-Galactosidasa/metabolismo,
Feto Abortado,
Análisis de Varianza,
Células Cultivadas,
Daño del ADN,
Rayos gamma,
Perfilación de la Expresión Génica,
Immunoblotting,
Pulmón,
Análisis de Secuencia de ARN,
Factores de Tiempo
